افتتحت مستشفى الخير أربعة عشر عيادة تخصصية متنوعة، في محاولة للتخفيف من العبء المادي لسكان جنوب قطاع غزة .
وتسعى الخير من خلال تلك العيادات لتوفير الخدمات الصحية اللازمة، في ظل  تدهور المنظومة الصحية في قطاع غزة، والنقص الشديد في الأدوية والمستلزمات الطبية، والتي تشمل على مجموعة من الأقسام والعيادات المتخصصة وهي:
•    عيادة الجلدية
•    الأنف والأذن والحنجرة
•    عيادة الجراحة العامة
•    عيادة العظام
•    عيادة الباطنة
•    عيادة الأطفال
•    عيادة النساء والتوليد
•    عيادة المسالك البولية
•    عيادة القلب
•    عيادة العيون
•    قسم الأشعة
•    قسم الألتراساوند
وبمناسبة افتتاح هذه العيادات أطلقت مستشفى الخير الأسبوع الطبي المجاني والذي يهدف لمساعدة العائلات محدودة الدخل في محافظة خانيونس جنوب قطاع غزة، وتنوعت الخدمات المجانية التي تقدمها المستشفى بين الكشف الطبي والأدوية وخدمات المختبر.
وتعتبر مستشفى الخير من أهم وأكبر المشاريع التي عملت على تنفيذها مؤسسة الخير في قطاع غزة- فلسطين، في إطار التزامها بأهداف التنمية المستدامة للصحة وتطوير القطاع الصحي المتردي في غزة بسبب الحصار المتواصل، والأزمات المتلاحقة، و التي يعتبر آخرها تفشي وباء كورونا، والعدوان الأخير على غزة.